新疆維吾爾醫學專科學校是1989年9月國家教委正式批準成立的。
學校占地總面積 66667平方米，建筑面積達19000平方米。學校用維吾爾語授課，開設 2個專業，26門課程，其中13種維醫、藥專業課程教材是由本校組織著名老專家編寫而成，還開設有成人教育科。
學校現有教職1248人（含附屬醫院職工），專職教師和兼職教師90人，其中教授（含主任醫師）、副教授（含副主任醫師）15人、講師（含主任醫師30人）、助教（含醫師）45人。學校擁有教學樓1座，實驗樓2座，其中有7個實驗室、1個電教室、5個標本室以及配套的維吾爾醫藥研究室，1座可藏書25萬冊的圖書館和10320平方米的室外體育場。下設一個附屬醫院，開設有內科、外科、婦科、門診、急診室和一所中型制藥廠，醫院擁有150張床位。學校還有教職工宿舍、食堂、鍋爐房、浴室、醫務室等配套的后勤設施。校園綠樹成陰，環境優美、其樹木、花草、果樹覆蓋率達90％以上。
建校以來，已有7屆畢業生走上工作崗位，學校教師及醫藥學人員撰寫的110多篇學術論文，論著在自治區和全國性學術研討會上進行了宣讀及有關報刊雜志上發表。學校編輯出版《新疆維吾爾醫學專科學校學報》。
新疆維吾爾醫學專科學校學科強項
學校現有132名教職工(含附屬機構工作人員)。其中專職教師有73名，高級職稱7名，中級職稱32名。
學校受自治區衛生廳和和田地區行署雙重管理，學校中層機構有16個，即維吾爾醫學系、維吾爾藥學系、醫學基礎部、成人教育部，紀檢委、工會、黨辦、校辦、組織部、人事處、宣傳部、總務處、學生處、教務處、圖書館，其中黨辦和校辦、組織部和人事處兩塊牌子一套班子。
學校下屬有一個直屬醫院，該醫院是有70張床位的一級醫院，還有一個校辦制藥廠，主要生產有“愛維心口服液”及10多種醫院制劑。此外，和田地區維吾爾醫院為我校附屬醫院。
新疆維吾爾醫學專科學校專業設置
學校現開設有維吾爾醫醫療、維吾爾醫藥學和維吾爾醫高級護理等三個專業，教育層次有普通專科、成人專科和成人本科，全校均用維吾爾語授課。